Cik lielā mērā ir samazinājusies Omikrona toksicitāte? Vairāki reālās pasaules pētījumi atklāj

“Omikrona virulence ir tuva sezonālās gripas virulencei” un “Omikrons ir ievērojami mazāk patogēns nekā Delta”. …… Nesen internetā ir izplatījušās daudzas ziņas par jaunā kroņa mutanta celma Omikrona virulenci.

Patiešām, kopš Omikrona mutanta celma parādīšanās 2021. gada novembrī un tā globālās izplatības pētījumi un diskusijas par virulenci un pārnešanu ir nepārtraukti turpinājušās. Kāds ir pašreizējais Omikrona virulences profils? Ko par to saka pētījumi?

Dažādi laboratorijas pētījumi: Omikrons ir mazāk virulents
Patiesībā jau 2022. gada janvārī Honkongas Universitātes Li Ka Šinga Medicīnas fakultātes pētījumā tika atklāts, ka Omicron (B.1.1.529) var būt mazāk patogēns salīdzinājumā ar sākotnējo celmu un citiem mutantu celmiem.
Tika konstatēts, ka Omicron mutanta celms neefektīvi izmanto transmembrānas serīna proteāzi (TMPRSS2), savukārt TMPRSS2 var veicināt vīrusa invāziju saimniekšūnās, šķeļot jaunā koronavīrusa smailes proteīnu. Vienlaikus pētnieki novēroja, ka Omicron replikācija bija ievērojami samazināta cilvēka šūnu līnijās Calu3 un Caco2.

Attēla avots: internets

k18-hACE2 peles modelī omikrona replikācija bija samazināta gan peļu augšējos, gan apakšējos elpceļos, salīdzinot ar sākotnējo celmu un Delta mutantu, un tās plaušu patoloģija bija mazāk smaga, savukārt omikrona infekcija izraisīja mazāku svara zudumu un mirstību nekā sākotnējā celms un Alfa, Beta un Delta mutanti.
Tāpēc pētnieki secināja, ka pelēm omikronu replikācija un patogenitāte bija samazināta.

Attēla avots: internets

2022. gada 16. maijā žurnāls Nature publicēja Tokijas Universitātes un Viskonsinas Universitātes vadošā virusologa Jošihiro Kavaokas rakstu, kurā pirmo reizi dzīvnieku modelī tika apstiprināts, ka Omicron BA.2 patiešām ir mazāk virulents nekā iepriekšējais sākotnējais celms.

Pētnieki atlasīja dzīvus BA.2 vīrusus, kas izolēti Japānā, lai inficētu k18-hACE2 peles un kāmjus, un atklāja, ka pēc inficēšanas ar vienādu vīrusa devu gan ar BA.2, gan BA.1 inficētajām pelēm plaušās un degunā bija ievērojami zemāki vīrusa titri nekā sākotnējās New Crown celma infekcijas gadījumā (p<0,0001).

Šis zelta standarta rezultāts apstiprina, ka Omicron patiešām ir mazāk virulents nekā sākotnējais savvaļas tips. Turpretī pēc BA.2 un BA.1 infekcijām dzīvnieku modeļu plaušās un degunos nebija būtiskas atšķirības vīrusu titros.

Attēla avots: internets

PCR vīrusu slodzes testi parādīja, ka gan ar BA.2, gan BA.1 inficētām pelēm plaušās un degunā bija zemāka vīrusu slodze nekā sākotnējai New Crown celmam, īpaši plaušās (p<0,0001).

Līdzīgi kā ar pelēm, ar BA.2 un BA.1 inficēto kāmju degunā un plaušās konstatētie vīrusu titri bija zemāki nekā sākotnējam celmam pēc “inokulācijas” ar tādu pašu vīrusa devu, īpaši plaušās, un nedaudz zemāki ar BA.2 inficēto kāmju degunā nekā ar BA.1 – patiesībā pusei no ar BA.2 inficētajiem kāmjiem plaušu infekcija neattīstījās.

Turklāt tika atklāts, ka sākotnējiem celmiem BA.2 un BA.1 pēc inficēšanās trūka serumu krusteniskās neitralizācijas, kas atbilst tam, kas novērots reālās pasaules cilvēkiem, inficējoties ar dažādiem jauniem krona mutantiem.

Attēla avots: internets

Reālās pasaules dati: Omikrons retāk izraisa nopietnas slimības

Vairākos no iepriekš minētajiem pētījumiem ir aprakstīta Omicron samazināta virulence laboratorijas dzīvnieku modeļos, bet vai tas pats attiecas uz reālo pasauli?

2022. gada 7. jūnijā PVO publicēja ziņojumu, kurā novērtēta atšķirība inficēto cilvēku slimības smagumā Omikrona (B.1.1.529) epidēmijas laikā salīdzinājumā ar Delta pandēmiju.

Ziņojumā bija iekļauti 16 749 jauni koronārās slimības stacionāra pacienti no visām Dienvidāfrikas provincēm, tostarp 16 749 pacienti Delta epidēmijas laikā (no 2021. gada 2. augusta līdz 2021. gada 3. oktobrim) un 17 693 pacienti Omikrona epidēmijas laikā (no 2021. gada 15. novembra līdz 2022. gada 16. februārim). Pacienti tika klasificēti arī kā smagi, nopietni un nenopietni.

kritiski svarīgi: ja saņemta invazīva plaušu ventilācija vai skābeklis un augstas plūsmas transnazāls skābeklis, vai ekstrakorporāla membrānas oksigenācija (ECMO), vai ja pacients ir ievietots intensīvās terapijas nodaļā hospitalizācijas laikā.
-smaga (smaga): hospitalizācijas laikā saņēma skābekli
-ne smaga: ja neviens no iepriekš minētajiem nosacījumiem nav izpildīts, pacienta stāvoklis nav smags.

Dati liecināja, ka Delta grupā 49,2 % gadījumu slimības gaita bija nopietna, 7,7 % — kritiska un 28 % no visiem hospitalizētajiem ar Delta infekciju inficētajiem pacientiem nomira, savukārt Omikrona grupā 28,1 % gadījumu slimības gaita bija nopietna, 3,7 % — kritiska un 15 % no visiem hospitalizētajiem ar Omikrona infekciju inficētajiem pacientiem nomira. Arī vidējais uzturēšanās ilgums Delta grupā bija 7 dienas, salīdzinot ar 6 dienām Omikrona grupā.

Turklāt ziņojumā tika analizēti ietekmējošie faktori, piemēram, vecums, dzimums, vakcinācijas statuss un komorbiditāšu klātbūtne, un tika secināts, ka Omicron (B.1.1.529) lietošana bija saistīta ar zemāku nopietnu un kritisku slimību iespējamību (95 % TI: 0,41 līdz 0,46; p < 0,001) un zemāku slimnīcā notikušas nāves risku (95 % TI: 0,59 līdz 0,65; p < 0,001).

Attēla avots: internets

Attiecībā uz dažādiem Omikrona apakštipiem turpmākajos pētījumos ir detalizēti analizēta arī to virulence.

Kohortas pētījumā no Jaunanglijas tika analizēti 20 770 Delta gadījumi, 52 605 Omicron B.1.1.529 gadījumi un 29 840 Omicron BA.2 gadījumi, un tika konstatēts, ka nāves gadījumu īpatsvars Delta gadījumā bija 0,7 %, B.1.1.529 gadījumā 0,4 % un BA.2 gadījumā 0,3 %. Pēc korekcijas attiecībā uz traucējošiem faktoriem pētījumā tika secināts, ka nāves risks BA.2 gadījumā bija ievērojami zemāks nekā gan Delta, gan B.1.1.529 gadījumā.

Attēla avots: internets

Citā Dienvidāfrikā veiktā pētījumā tika novērtēts hospitalizācijas risks un smagas slimības iznākuma risks Delta, BA.1, BA.2 un BA.4/BA.5 gadījumā. Rezultāti parādīja, ka no 98 710 analīzē iekļautajiem jauninficētajiem pacientiem 3825 (3,9 %) tika ievietoti slimnīcā, no kuriem 1276 (33,4 %) attīstījās smaga slimība.

No tiem, kas bija inficēti ar dažādām mutācijām, 57,7 % pacientu, kas inficēti ar Delta mutāciju, attīstījās smaga slimība (97/168), salīdzinot ar 33,7 % pacientu, kas inficēti ar BA.1 mutāciju (990/2940), 26,2 % pacientu, kas inficēti ar BA.2 mutāciju (167/637), un 27,5 % pacientu, kas inficēti ar BA.4/BA.5 mutāciju (22/80). Daudzfaktoru analīze parādīja, ka nopietnas slimības attīstības varbūtība tiem, kas inficēti ar Delta > BA.1 > BA.2 mutāciju, savukārt nopietnas slimības attīstības varbūtība tiem, kas inficēti ar BA.4/BA.5 mutāciju, nebija būtiski atšķirīga salīdzinājumā ar BA.2 mutāciju.
Samazināta virulence, bet nepieciešama modrība

Laboratorijas pētījumi un reāli dati no vairākām valstīm ir parādījuši, ka Omicron un tā apakštipi ir mazāk virulents un retāk izraisa nopietnas slimības nekā sākotnējais celms un citi mutantu celmi.

Tomēr 2022. gada janvāra žurnāla “The Lancet” numurā publicētajā pārskata rakstā ar nosaukumu “Vieglāka, bet ne viegla” tika atzīmēts, ka, lai gan omikrona infekcija veidoja 21 % no hospitalizācijas gadījumiem jaunākā Dienvidāfrikas iedzīvotāju vidū, uzliesmojumu īpatsvars, kas izraisa smagu slimību, visticamāk, palielināsies populācijās ar atšķirīgu infekcijas līmeni un atšķirīgu vakcinācijas līmeni. (Tomēr šajā kopumā jaunajā Dienvidāfrikas populācijā 21 % hospitalizēto pacientu, kas inficēti ar SARS-CoV-2 omikrona variantu, bija smaga klīniskā iznākuma, un šī proporcija varētu palielināties un radīt būtisku ietekmi uzliesmojumu laikā populācijās ar atšķirīgu demogrāfisko sastāvu un zemāku infekcijas vai vakcīnas izraisītas imunitātes līmeni.)

Iepriekš minētā PVO ziņojuma beigās komanda atzīmēja, ka, neskatoties uz iepriekšējā celma samazināto virulenci, gandrīz trešdaļai hospitalizēto Omicron (B.1.1.529) pacientu attīstījās smaga slimība un ka dažādie jaunie krona mutanti turpināja izraisīt augstu saslimstību un mirstību gados vecākiem cilvēkiem, cilvēkiem ar imūndeficītu vai nevakcinētām populācijām. (Mēs arī vēlamies brīdināt, ka mūsu analīze nav jāuztver kā tāda, kas atbalsta "vieglā" varianta naratīvu. Gandrīz trešdaļai hospitalizēto Omicron pacientu attīstījās smaga slimība un 15% nomira; skaitļi, kas nav nenozīmīgi... Neaizsargātu iedzīvotāju vidū, t. i., pacientiem ļoti vecos gados, populācijās ar augstu komorbiditāšu slogu, vājiem pacientiem un nevakcinētiem, COVID-19 (visi GOS) turpina veicināt ievērojamu saslimstību un mirstību.)

Iepriekšējie Omicron dati, kas tika apkopoti, kad tas izraisīja piekto pandēmijas vilni Honkongā, liecināja, ka līdz 2022. gada 4. maijam piektā viļņa laikā no 1 192 765 jaunkronētiem gadījumiem bija 9115 nāves gadījumi (aptuvenais mirstības līmenis 0,76%) un aptuvenais mirstības līmenis cilvēkiem, kas vecāki par 60 gadiem, bija 2,70% (aptuveni 19,30% no šīs vecuma grupas bija nevakcinēti).

Turpretī tikai 2% Jaunzēlandes iedzīvotāju, kas vecāki par 60 gadiem, nav vakcinēti, kas ir cieši saistīts ar zemu bruto mirstības līmeni jaunās koronavīrusa epidēmijas gadījumā – 0,07%.

No otras puses, lai gan bieži tiek apgalvots, ka Ņūkāsla nākotnē varētu kļūt par sezonālu, endēmisku slimību, ir akadēmiskie eksperti, kuriem ir atšķirīgs viedoklis.

Trīs zinātnieki no Oksfordas Universitātes un Eiropas Savienības Kopīgā pētniecības centra uzskata, ka Omikrona zemāka smaguma pakāpe var būt vienkārši sakritība un ka nepārtraukta strauja antigēnu evolūcija (antigēnu evolūcija) var radīt jaunus variantus.

Atšķirībā no imūnsistēmas izvairīšanās un transmisijas, kas ir pakļautas spēcīgam evolūcijas spiedienam, virulence parasti ir tikai evolūcijas "blakusprodukts". Vīrusi attīstās, lai maksimāli palielinātu savu spēju izplatīties, un tas var izraisīt arī virulences palielināšanos. Piemēram, palielinot vīrusu slodzi, lai veicinātu transmisiju, tas joprojām var izraisīt smagāku slimību.

Turklāt virulence vīrusa izplatīšanās laikā nodarīs ļoti ierobežotu kaitējumu, ja vīrusa izraisītie simptomi galvenokārt parādās vēlāk infekcijas stadijā, piemēram, gripas vīrusu, HIV un C hepatīta vīrusu gadījumā, kuriem ir daudz laika izplatīties, pirms tie rada nopietnas sekas.

Attēla avots: internets

Šādos apstākļos var būt grūti paredzēt jaunā krona mutanta celma tendences, ņemot vērā Omicron zemāko virulenci, taču labā ziņa ir tā, ka jaunā krona vakcīna ir pierādījusi samazinātu smagas slimības un nāves risku pret visiem mutantu celmiem, un agresīvi palielināt iedzīvotāju vakcinācijas līmeni joprojām ir svarīgs veids, kā cīnīties pret epidēmiju šajā posmā.
Pateicības: Šo rakstu profesionāli recenzēja Panpans Džou, PhD, Tsinghua Universitātes Medicīnas skola un pēcdotorantūras stipendiāts Scripps pētniecības institūtā, ASV.
Omicron pašpārbaudes antigēna reaģents mājās